Loos Group

Genome Analyses of >200,000 Individuals Identify 58 Loci for Chronic Inflammation and Highlight Pathways that Link Inflammation and Complex Disorders

Ligthart, S., Vaez, A., Vosa, U., Stathopoulou, M. G., de Vries, P. S., Prins, B. P., Van der Most, P. J., Tanaka, T., Naderi, E., Rose, L. M., Wu, Y., Karlsson, R., Barbalic, M., Lin, H., Pool, R., Zhu, G., Mace, A., Sidore, C., Trompet, S., Mangino, M. & 266 others, Sabater-Lleal, M., Kemp, J. P., Abbasi, A., Kacprowski, T., Verweij, N., Smith, A. V., Huang, T., Marzi, C., Feitosa, M. F., Lohman, K. K., Kleber, M. E., Milaneschi, Y., Mueller, C., Huq, M., Vlachopoulou, E., Lyytikainen, L., Oldmeadow, C., Deelen, J., Perola, M., Zhao, J., Feenstra, B., Amini, M., Lahti, J., Schraut, K. E., Fornage, M., Suktitipat, B., Chen, W., Li, X., Nutile, T., Malerba, G., Luan, J., Bak, T., Schork, N., Del Greco, F. M., Thiering, E., Mahajan, A., Marioni, R. E., Mihailov, E., Eriksson, J., Ozel, A. B., Zhang, W., Nethander, M., Cheng, Y., Aslibekyan, S., Ang, W., Gandin, I., Yengo, L., Portas, L., Kooperberg, C., Hofer, E., Rajan, K. B., Schurmann, C., den Hollander, W., Ahluwalia, Tarun Veer Singh, Zhao, J., Draisma, H. H. M., Ford, I., Timpson, N., Teumer, A., Huang, H., Wahl, S., Liu, Y., Huang, J., Uh, H., Geller, F., Joshi, P. K., Yanek, L. R., Trabetti, E., Lehne, B., Vozzi, D., Verbanck, M., Biino, G., Saba, Y., Meulenbelt, I., O'Connell, J. R., Laakso, M., Giulianini, F., Magnusson, P. K. E., Ballantyne, C. M., Hottenga, J. J., Montgomery, G., Rivadineira, F., Rueedi, R., Steri, M., Herzig, K., Stott, D. J., Menni, C., Franberg, M., St Pourcain, B., Felix, S. B., Pers, Tune H, Bakker, S. J. L., Kraft, P., Peters, A., Vaidya, D., Delgado, G., Smit, J. H., Grossmann, V., Sinisalo, J., Seppala, I., Williams, S. R., Holliday, E. G., Moed, M., Langenberg, C., Raikkonen, K., Ding, J., Campbell, H., Sale, M. M., Chen, Y. I., James, A. L., Ruggiero, D., Soranzo, N., Hartman, C. A., Smith, E. N., Berenson, G. S., Fuchsberger, C., Hernandez, D., Tiesler, C. M. T., Giedraitis, V., Liewald, D., Fischer, K., Mellstrom, D., Larsson, A., Wang, Y., Scott, W. R., Lorentzon, M., Beilby, J., Ryan, K. A., Pennell, C. E., Vuckovic, D., Balkau, B., Concas, M. P., Schmidt, R., de Leon, C. F. M., Bottinger, E. P., Kloppenburg, M., Paternoster, L., Boehnke, M., Musk, A. W., Willemsen, G., Evans, D. M., Madden, P. A. F., Kahonen, M., Kutalik, Z., Zoledziewska, M., Karhunen, V., Kritchevsky, S. B., Sattar, N., Lachance, G., Clarke, R., Harris, T. B., Raitakari, O. T., Attia, J. R., Van Heemst, D., Kajantie, E., Sorice, R., Gambaro, G., Scott, R. A., Hicks, A. A., Ferrucci, L., Standl, M., Lindgren, C. M., Starr, J. M., Karlsson, M., Lind, L., Li, J. Z., Chambers, J. C., Mori, T. A., de Geus, E. J. C. N., Heath, A. C., Martin, N. G., Auvinen, J., Buckley, B. M., de Craen, A. J. M., Waldenberger, M., Strauch, K., Meitinger, T., Scott, R. J., McEvoy, M., Beekman, M., Bombieri, C., Ridker, P. M., Mohlke, K. L., Pedersen, N. L., Morrison, A. C., Boomsma, D. I., Whitfield, J. B., Strachan, D. P., Hofman, A., Vollenweider, P., Cucca, F., Jarvelin, M., Jukema, J. W., Spector, T. D., Hamsten, A., Zeller, T., Uitterlinden, A. G., Nauck, M., Gudnason, V., Qi, L., Grallert, H., Borecki, I. B., Rotter, J. I., Maerz, W., Wild, P. S., Lokki, M., Boyle, M., Salomaa, V., Melbye, M., Eriksson, J. G., Wilson, J. F., Penninx, B. W. J. H., Becker, D. M., Worrall, B. B., Gibson, G., Krauss, R. M., Ciullo, M., Zaza, G., Wareham, N. J., Oldehinkel, A. J., Palmer, L. J., Murray, S. S., Pramstaller, P. P., Bandinelli, S., Heinrich, J., Ingelsson, E., Deary, I. J., Magi, R., Vandenput, L., van der Harst, P., Desch, K. C., Kooner, J. S., Ohlsson, C., Hayward, C., Lehtimaki, T., Shuldiner, A. R., Arnett, D. K., Beilin, L. J., Robino, A., Froguel, P., Pirastu, M., Jess, T., Koenig, W., Loos, Ruth, Evans, D. A., Schmidt, H., Smith, G. D., Slagboom, P. E., Eiriksdottir, G., Morris, A. P., Psaty, B. M., Tracy, R. P., Nolte, I. M., Boerwinkle, E., Visvikis-Siest, S., Reiner, A. P., Gross, M., Bis, J. C., Franke, L., Franco, O. H., Benjamin, E. J., Chasman, D. I., Dupuis, J., Snieder, H., Dehghan, A. & Alizadeh, B. Z., 1 Nov 2018, In: American Journal of Human Genetics. 103, 5, p. 691-706

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The genetics of obesity: from discovery to biology

Loos, Ruth & Yeo, G. S. H., 2021, In: Nature Reviews Genetics. 23, p. 120-133

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Mapping the human genetic architecture of COVID-19

Niemi, M. E. K., Karjalainen, J., Liao, R. G., Neale, B. M., Daly, M., Ganna, A., Pathak, G. A., Andrews, S. J., Kanai, M., Veerapen, K., Fernandez-Cadenas, I., Schulte, E. C., Striano, P., Marttila, M., Minica, C., Marouli, E., Karim, M. A., Wendt, F. R., Savage, J., Sloofman, L. & 41 others, Butler-Laporte, G., Kim, H., Kanoni, S., Okada, Y., Byun, J., Han, Y., Uddin, M. J., Smith, G. D., Willer, C. J., Buxbaum, J. D., Karjalainen, J., Mehtonen, J., Folkersen, L., Moltke, Ida, Hinney, A., Wang, C., Ellinghaus, D., Brunak, Søren, Castro, P., Guindo Martínez, Marta, Lee, J. Y., Loos, Ruth, Zhao, J. H., Sun, Y. V., Wang, B., Parker, R., Garcia, S. M., Smith, O., Davis, C., COVID-19 Host Genetics Initiative, C. H. G. I., 23andMe COVID-19 Team, 2. C. T., Norwegian SARS-CoV-2 Study Grp, N. S. S. G., Humanitas COVID-19 Task Force, H. C. T. F., Humanitas Gavazzeni COVID-19 Task, H. G. C. T., FHoGID, F., RegCOVID, R., P-PredictUs, P., SeroCOVID, S., CRiPSI, C., Genes & Hlth Res Team, G. &. H. R. T. & UCLA Hlth ATLAS Data Mart Working, U. H. A. D. M. W., 2021, In: Nature. 600, p. 472-477

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The impact of anorexia nervosa and BMI polygenic risk on childhood growth: A 20-year longitudinal population-based study

Abdulkadir, M., Hübel, C., Herle, M., Loos, Ruth, Breen, G., Bulik, C. M. & Micali, N., 2022, In: American Journal of Human Genetics. 109, 7, p. 1242-1254 13 p.

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Clinical Characterization of Copy Number Variants Associated with Neurodevelopmental Disorders in a Large-scale Multiancestry Biobank

Birnbaum, R., Mahjani, B., Loos, Ruth & Sharp, A. J., 2022, In: JAMA Psychiatry. 79, 3, p. 250-259

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Ancestral diversity improves discovery and fine-mapping of genetic loci for anthropometric traits—The Hispanic/Latino Anthropometry Consortium

Fernández-Rhodes, L., Graff, M., Buchanan, V. L., Justice, A. E., Highland, H. M., Guo, X., Zhu, W., Chen, H. H., Young, K. L., Adhikari, K., Palmer, N. D., Below, J. E., Bradfield, J., Pereira, A. C., Glover, L. S., Kim, D., Lilly, A. G., Shrestha, P., Thomas, A. G., Zhang, X. & 96 others, Chen, M., Chiang, C. W. K., Pulit, S., Horimoto, A., Krieger, J. E., Guindo Martínez, Marta, Preuss, M., Schumann, C., Smit, R. A. J., Torres-Mejía, G., Acuña-Alonzo, V., Bedoya, G., Bortolini, M. C., Canizales-Quinteros, S., Gallo, C., González-José, R., Poletti, G., Rothhammer, F., Hakonarson, H., Igo, R., Adler, S. G., Iyengar, S. K., Nicholas, S. B., Gogarten, S. M., Isasi, C. R., Papnicolaou, G., Stilp, A. M., Qi, Q., Kho, M., Smith, J. A., Langefeld, C. D., Wagenknecht, L., Mckean-Cowdin, R., Gao, X. R., Nousome, D., Conti, D. V., Feng, Y., Allison, M. A., Arzumanyan, Z., Buchanan, T. A., Ida Chen, Y. D., Genter, P. M., Goodarzi, M. O., Hai, Y., Hsueh, W., Ipp, E., Kandeel, F. R., Lam, K., Li, X., Nadler, J. L., Raffel, L. J., Roll, K., Sandow, K., Tan, J., Taylor, K. D., Xiang, A. H., Yao, J., Audirac-Chalifour, A., de Jesus Peralta Romero, J., Hartwig, F., Horta, B., Blangero, J., Curran, J. E., Duggirala, R., Lehman, D. E., Puppala, S., Fejerman, L., John, E. M., Aguilar-Salinas, C., Burtt, N. P., Florez, J. C., García-Ortíz, H., González-Villalpando, C., Mercader, J., Orozco, L., Tusié-Luna, T., Blanco, E., Gahagan, S., Cox, N. J., Hanis, C., Butte, N. F., Cole, S. A., Comuzzie, A. G., Voruganti, V. S., Rohde, R., Wang, Y., Sofer, T., Ziv, E., Grant, S. F. A., Ruiz-Linares, A., Rotter, J. I., Haiman, C. A., Parra, E. J., Cruz, M., Loos, Ruth & North, K. E., 2022, In: Human Genetics and Genomics Advances. 3, 2, 21 p., 100099.

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The energy balance model of obesity: beyond calories in, calories out

Hall, K. D., Farooqi, I. S., Friedman, J. M., Klein, S., Loos, Ruth, Mangelsdorf, D. J., O'Rahilly, S., Ravussin, E., Redman, L. M., Ryan, D. H., Speakman, J. R. & Tobias, D. K., 2022, In: American Journal of Clinical Nutrition. 115, 5, p. 1243-1254 12 p.

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Genomics and phenomics of body mass index reveals a complex disease network

Huang, J., Huffman, J. E., Huang, Y., Do Valle, Í., Assimes, T. L., Raghavan, S., Voight, B. F., Liu, C., Barabási, A. L., Huang, R. D. L., Hui, Q., Nguyen, X. M. T., Ho, Y. L., Djousse, L., Lynch, J. A., Vujkovic, M., Tcheandjieu, C., Tang, H., Damrauer, S. M., Reaven, P. D. & 19 others, Miller, D., Phillips, L. S., Ng, M. C. Y., Graff, M., Haiman, C. A., Loos, Ruth, North, K. E., Yengo, L., Smith, G. D., Saleheen, D., Gaziano, J. M., Rader, D. J., Tsao, P. S., Cho, K., Chang, K. M., Wilson, P. W. F., Sun, Y. V., O’Donnell, C. J. & VA Million Veteran Program, V. M. V. P., 2022, In: Nature Communications. 13, 1, 10 p., 7973.

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TOP-LD: A tool to explore linkage disequilibrium with TOPMed whole-genome sequence data

Huang, L., Rosen, J. D., Sun, Q., Chen, J., Wheeler, M. M., Zhou, Y., Min, Y. I., Kooperberg, C., Conomos, M. P., Stilp, A. M., Rich, S. S., Rotter, J. I., Manichaikul, A., Loos, R. J. F., Kenny, E. E., Blackwell, T. W., Smith, A. V., Jun, G., Sedlazeck, F. J., Metcalf, G. & 6 others, Boerwinkle, E., Raffield, L. M., Reiner, A. P., Auer, P. L., Li, Y. & NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) Consortium, N. T. F. P. M. (. C., 2022, In: American Journal of Human Genetics. 109, 6, p. 1175-1181 7 p.

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Implicating genes, pleiotropy, and sexual dimorphism at blood lipid loci through multi-ancestry meta-analysis

Kanoni, S., Graham, S. E., Wang, Y., Surakka, I., Ramdas, S., Zhu, X., Clarke, S. L., Bhatti, K. F., Vedantam, S., Winkler, T. W., Locke, A. E., Marouli, E., Zajac, G. J. M., Wu, K. H. H., Ntalla, I., Hui, Q., Klarin, D., Hilliard, A. T., Wang, Z., Xue, C. & 519 others, Thorleifsson, G., Helgadottir, A., Gudbjartsson, D. F., Holm, H., Olafsson, I., Hwang, M. Y., Han, S., Akiyama, M., Sakaue, S., Terao, C., Kanai, M., Zhou, W., Brumpton, B. M., Rasheed, H., Havulinna, A. S., Veturi, Y., Pacheco, J. A., Rosenthal, E. A., Lingren, T., Feng, Q. P., Kullo, I. J., Narita, A., Takayama, J., Martin, H. C., Hunt, K. A., Trivedi, B., Haessler, J., Giulianini, F., Bradford, Y., Miller, J. E., Campbell, A., Lin, K., Millwood, I. Y., Rasheed, A., Hindy, G., Faul, J. D., Zhao, W., Weir, D. R., Turman, C., Huang, H., Graff, M., Choudhury, A., Sengupta, D., Mahajan, A., Brown, M. R., Zhang, W., Yu, K., Schmidt, E. M., Pandit, A., Gustafsson, S., Yin, X., Luan, J., Zhao, J. H., Matsuda, F., Jang, H. M., Yoon, K., Medina-Gomez, C., Pitsillides, A., Hottenga, J. J., Wood, A. R., Ji, Y., Gao, Z., Haworth, S., Yousri, N. A., Mitchell, R. E., Chai, J. F., Aadahl, Mette, Bjerregaard, A. A., Yao, J., Manichaikul, A., Hwu, C. M., Hung, Y. J., Warren, H. R., Ramirez, J., Bork-Jensen, J., Kårhus, L. L., Goel, A., Sabater-Lleal, M., Noordam, R., Mauro, P., Matteo, F., McDaid, A. F., Marques-Vidal, P., Wielscher, M., Trompet, S., Sattar, N., Møllehave, L. T., Munz, M., Zeng, L., Huang, J., Yang, B., Poveda, A., Kurbasic, A., Lamina, C., Forer, L., Scholz, M., Galesloot, T. E., Bradfield, J. P., Ruotsalainen, S. E., Daw, E., Zmuda, J. M., Mitchell, J. S., Fuchsberger, C., Christensen, H., Brody, J. A., Vazquez-Moreno, M., Feitosa, M. F., Wojczynski, M. K., Wang, Z., Preuss, M. H., Mangino, M., Christofidou, P., Verweij, N., Benjamins, J. W., Engmann, J., Tsao, N. L., Verma, A., Slieker, R. C., Lo, K. S., Zilhao, N. R., Le, P., Kleber, M. E., Delgado, G. E., Huo, S., Ikeda, D. D., Iha, H., Yang, J., Liu, J., Demirkan, A., Leonard, H. L., Marten, J., Frank, M., Schmidt, B., Smyth, L. J., Cañadas-Garre, M., Wang, C., Nakatochi, M., Wong, A., Hutri-Kähönen, N., Sim, X., Xia, R., Huerta-Chagoya, A., Fernandez-Lopez, J. C., Lyssenko, V., Nongmaithem, S. S., Bayyana, S., Stringham, H. M., Irvin, M. R., Oldmeadow, C., Kim, H. N., Ryu, S., Timmers, P. R. H. J., Arbeeva, L., Dorajoo, R., Lange, L. A., Prasad, G., Lorés-Motta, L., Pauper, M., Long, J., Li, X., Theusch, E., Takeuchi, F., Spracklen, C. N., Loukola, A., Bollepalli, S., Warner, S. C., Wang, Y. X., Wei, W. B., Nutile, T., Ruggiero, D., Sung, Y. J., Chen, S., Liu, F., Yang, J., Kentistou, K. A., Banas, B., Nardone, G. G., Meidtner, K., Bielak, L. F., Smith, J. A., Hebbar, P., Farmaki, A. E., Hofer, E., Lin, M., Concas, M. P., Vaccargiu, S., van der Most, P. J., Pitkänen, N., Cade, B. E., van der Laan, S. W., Chitrala, K. N., Weiss, S., Bentley, A. R., Doumatey, A. P., Adeyemo, A. A., Lee, J. Y., Petersen, E. R. B., Nielsen, A. A., Choi, H. S., Nethander, M., Freitag-Wolf, S., Southam, L., Rayner, N. W., Wang, C. A., Lin, S. Y., Wang, J. S., Couture, C., Lyytikäinen, L. P., Nikus, K., Cuellar-Partida, G., Vestergaard, H., Hidalgo, B., Giannakopoulou, O., Cai, Q., Obura, M. O., van Setten, J., Li, X., Liang, J., Tang, H., Terzikhan, N., Shin, J. H., Jackson, R. D., Reiner, A. P., Martin, L. W., Chen, Z., Li, L., Kawaguchi, T., Thiery, J., Bis, J. C., Launer, L. J., Li, H., Nalls, M. A., Raitakari, O. T., Ichihara, S., Wild, S. H., Nelson, C. P., Campbell, H., Jäger, S., Nabika, T., Al-Mulla, F., Niinikoski, H., Braund, P. S., Kolcic, I., Kovacs, P., Giardoglou, T., Katsuya, T., de Kleijn, D., de Borst, G. J., Kim, E. K., Adams, H. H. H., Ikram, M. A., Zhu, X., Asselbergs, F. W., Kraaijeveld, A. O., Beulens, J. W. J., Shu, X. O., Rallidis, L. S., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Mitchell, P., Hewitt, A. W., Kähönen, M., Pérusse, L., Bouchard, C., Tönjes, A., Chen, Y. D. I., Pennell, C. E., Mori, T. A., Lieb, W., Franke, A., Ohlsson, C., Mellström, D., Cho, Y. S., Lee, H., Yuan, J. M., Koh, W. P., Rhee, S. Y., Woo, J. T., Heid, I. M., Stark, K. J., Zimmermann, M. E., Völzke, H., Homuth, G., Evans, M. K., Zonderman, A. B., Polasek, O., Pasterkamp, G., Hoefer, I. E., Redline, S., Pahkala, K., Oldehinkel, A. J., Snieder, H., Biino, G., Schmidt, R., Schmidt, H., Bandinelli, S., Dedoussis, G., Thanaraj, T. A., Kardia, S. L. R., Peyser, P. A., Kato, N., Schulze, M. B., Girotto, G., Böger, C. A., Jung, B., Joshi, P. K., Bennett, D. A., De Jager, P. L., Lu, X., Mamakou, V., Brown, M., Caulfield, M. J., Munroe, P. B., Guo, X., Ciullo, M., Jonas, J. B., Samani, N. J., Kaprio, J., Pajukanta, P., Tusié-Luna, T., Aguilar-Salinas, C. A., Adair, L. S., Bechayda, S. A., de Silva, H. J., Wickremasinghe, A. R., Krauss, R. M., Wu, J. Y., Zheng, W., Hollander, A. I., Bharadwaj, D., Correa, A., Wilson, J. G., Lind, L., Heng, C. K., Nelson, A. E., Golightly, Y. M., Wilson, J. F., Penninx, B., Kim, H. L., Attia, J., Scott, R. J., Rao, D. C., Arnett, D. K., Hunt, S. C., Walker, M., Koistinen, H. A., Chandak, G. R., Mercader, J. M., Costanzo, M. C., Jang, D., Burtt, N. P., Villalpando, C. G., Orozco, L., Fornage, M., Tai, E., van Dam, R. M., Lehtimäki, T., Chaturvedi, N., Yokota, M., Liu, J., Reilly, D. F., McKnight, A. J., Kee, F., Jöckel, K. H., McCarthy, M. I., Palmer, C. N. A., Vitart, V., Hayward, C., Simonsick, E., van Duijn, C. M., Jin, Z. B., Qu, J., Hishigaki, H., Lin, X., März, W., Gudnason, V., Tardif, J. C., Lettre, G., Hart, L. M. T., Elders, P. J. M., Damrauer, S. M., Kumari, M., Kivimaki, M., van der Harst, P., Spector, T. D., Loos, Ruth, Province, M. A., Parra, E. J., Cruz, M., Psaty, B. M., Brandslund, I., Pramstaller, P. P., Rotimi, C. N., Christensen, K., Ripatti, S., Widén, E., Hakonarson, H., Grant, S. F. A., Kiemeney, L. A. L. M., de Graaf, J., Loeffler, M., Kronenberg, F., Gu, D., Erdmann, J., Schunkert, H., Franks, P. W., Linneberg, Allan René, Jukema, J. W., Khera, A. V., Männikkö, M., Jarvelin, M. R., Kutalik, Z., Francesco, C., Mook-Kanamori, D. O., van Dijk, K. W., Watkins, H., Strachan, D. P., Grarup, Niels, Sever, P., Poulter, N., Chuang, L. M., Rotter, J. I., Dantoft, T. M., Karpe, F., Neville, M. J., Timpson, N. J., Cheng, C. Y., Wong, T. Y., Khor, C. C., Li, H., Sabanayagam, C., Peters, A., Gieger, C., Hattersley, A. T., Pedersen, N. L., Magnusson, P. K. E., Boomsma, D. I., Willemsen, A. H. M., Cupples, L., van Meurs, J. B. J., Ghanbari, M., Gordon-Larsen, P., Huang, W., Kim, Y. J., Tabara, Y., Wareham, N. J., Langenberg, C., Zeggini, E., Kuusisto, J., Laakso, M., Ingelsson, E., Abecasis, G., Chambers, J. C., Kooner, J. S., de Vries, P. S., Morrison, A. C., Hazelhurst, S., Ramsay, M., North, K. E., Daviglus, M., Kraft, P., Martin, N. G., Whitfield, J. B., Abbas, S., Saleheen, D., Walters, R. G., Holmes, M. V., Black, C., Smith, B. H., Baras, A., Justice, A. E., Buring, J. E., Ridker, P. M., Chasman, D. I., Kooperberg, C., Tamiya, G., Yamamoto, M., van Heel, D. A., Trembath, R. C., Wei, W. Q., Jarvik, G. P., Namjou, B., Hayes, M. G., Ritchie, M. D., Jousilahti, P., Salomaa, V., Hveem, K., Åsvold, B. O., Kubo, M., Kamatani, Y., Okada, Y., Murakami, Y., Kim, B. J., Thorsteinsdottir, U., Stefansson, K., Zhang, J., Chen, Y., Ho, Y. L., Lynch, J. A., Rader, D. J., Tsao, P. S., Chang, K. M., Cho, K., O'Donnell, C. J., Gaziano, J. M., Wilson, P. W. F., Frayling, T. M., Hirschhorn, J. N., Kathiresan, S., Mohlke, K. L., Sun, Y. V., Morris, A. P., Boehnke, M., Brown, C. D., Natarajan, P., Deloukas, P., Willer, C. J., Assimes, T. L. & Peloso, G. M., 2022, In: Genome Biology. 23, 1, 42 p., 268.

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