Loos Group

Clinical Characterization of Copy Number Variants Associated with Neurodevelopmental Disorders in a Large-scale Multiancestry Biobank

Birnbaum, R., Mahjani, B., Loos, Ruth & Sharp, A. J., 2022, In: JAMA Psychiatry. 79, 3, p. 250-259

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Ancestral diversity improves discovery and fine-mapping of genetic loci for anthropometric traits—The Hispanic/Latino Anthropometry Consortium

Fernández-Rhodes, L., Graff, M., Buchanan, V. L., Justice, A. E., Highland, H. M., Guo, X., Zhu, W., Chen, H. H., Young, K. L., Adhikari, K., Palmer, N. D., Below, J. E., Bradfield, J., Pereira, A. C., Glover, L. S., Kim, D., Lilly, A. G., Shrestha, P., Thomas, A. G., Zhang, X. & 96 others, Chen, M., Chiang, C. W. K., Pulit, S., Horimoto, A., Krieger, J. E., Guindo Martínez, Marta, Preuss, M., Schumann, C., Smit, R. A. J., Torres-Mejía, G., Acuña-Alonzo, V., Bedoya, G., Bortolini, M. C., Canizales-Quinteros, S., Gallo, C., González-José, R., Poletti, G., Rothhammer, F., Hakonarson, H., Igo, R., Adler, S. G., Iyengar, S. K., Nicholas, S. B., Gogarten, S. M., Isasi, C. R., Papnicolaou, G., Stilp, A. M., Qi, Q., Kho, M., Smith, J. A., Langefeld, C. D., Wagenknecht, L., Mckean-Cowdin, R., Gao, X. R., Nousome, D., Conti, D. V., Feng, Y., Allison, M. A., Arzumanyan, Z., Buchanan, T. A., Ida Chen, Y. D., Genter, P. M., Goodarzi, M. O., Hai, Y., Hsueh, W., Ipp, E., Kandeel, F. R., Lam, K., Li, X., Nadler, J. L., Raffel, L. J., Roll, K., Sandow, K., Tan, J., Taylor, K. D., Xiang, A. H., Yao, J., Audirac-Chalifour, A., de Jesus Peralta Romero, J., Hartwig, F., Horta, B., Blangero, J., Curran, J. E., Duggirala, R., Lehman, D. E., Puppala, S., Fejerman, L., John, E. M., Aguilar-Salinas, C., Burtt, N. P., Florez, J. C., García-Ortíz, H., González-Villalpando, C., Mercader, J., Orozco, L., Tusié-Luna, T., Blanco, E., Gahagan, S., Cox, N. J., Hanis, C., Butte, N. F., Cole, S. A., Comuzzie, A. G., Voruganti, V. S., Rohde, R., Wang, Y., Sofer, T., Ziv, E., Grant, S. F. A., Ruiz-Linares, A., Rotter, J. I., Haiman, C. A., Parra, E. J., Cruz, M., Loos, Ruth & North, K. E., 2022, In: Human Genetics and Genomics Advances. 3, 2, 21 p., 100099.

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The energy balance model of obesity: beyond calories in, calories out

Hall, K. D., Farooqi, I. S., Friedman, J. M., Klein, S., Loos, Ruth, Mangelsdorf, D. J., O'Rahilly, S., Ravussin, E., Redman, L. M., Ryan, D. H., Speakman, J. R. & Tobias, D. K., 2022, In: American Journal of Clinical Nutrition. 115, 5, p. 1243-1254 12 p.

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Genomics and phenomics of body mass index reveals a complex disease network

Huang, J., Huffman, J. E., Huang, Y., Do Valle, Í., Assimes, T. L., Raghavan, S., Voight, B. F., Liu, C., Barabási, A. L., Huang, R. D. L., Hui, Q., Nguyen, X. M. T., Ho, Y. L., Djousse, L., Lynch, J. A., Vujkovic, M., Tcheandjieu, C., Tang, H., Damrauer, S. M., Reaven, P. D. & 19 others, Miller, D., Phillips, L. S., Ng, M. C. Y., Graff, M., Haiman, C. A., Loos, Ruth, North, K. E., Yengo, L., Smith, G. D., Saleheen, D., Gaziano, J. M., Rader, D. J., Tsao, P. S., Cho, K., Chang, K. M., Wilson, P. W. F., Sun, Y. V., O’Donnell, C. J. & VA Million Veteran Program, V. M. V. P., 2022, In: Nature Communications. 13, 1, 10 p., 7973.

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TOP-LD: A tool to explore linkage disequilibrium with TOPMed whole-genome sequence data

Huang, L., Rosen, J. D., Sun, Q., Chen, J., Wheeler, M. M., Zhou, Y., Min, Y. I., Kooperberg, C., Conomos, M. P., Stilp, A. M., Rich, S. S., Rotter, J. I., Manichaikul, A., Loos, R. J. F., Kenny, E. E., Blackwell, T. W., Smith, A. V., Jun, G., Sedlazeck, F. J., Metcalf, G. & 6 others, Boerwinkle, E., Raffield, L. M., Reiner, A. P., Auer, P. L., Li, Y. & NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) Consortium, N. T. F. P. M. (. C., 2022, In: American Journal of Human Genetics. 109, 6, p. 1175-1181 7 p.

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Implicating genes, pleiotropy, and sexual dimorphism at blood lipid loci through multi-ancestry meta-analysis

Kanoni, S., Graham, S. E., Wang, Y., Surakka, I., Ramdas, S., Zhu, X., Clarke, S. L., Bhatti, K. F., Vedantam, S., Winkler, T. W., Locke, A. E., Marouli, E., Zajac, G. J. M., Wu, K. H. H., Ntalla, I., Hui, Q., Klarin, D., Hilliard, A. T., Wang, Z., Xue, C. & 519 others, Thorleifsson, G., Helgadottir, A., Gudbjartsson, D. F., Holm, H., Olafsson, I., Hwang, M. Y., Han, S., Akiyama, M., Sakaue, S., Terao, C., Kanai, M., Zhou, W., Brumpton, B. M., Rasheed, H., Havulinna, A. S., Veturi, Y., Pacheco, J. A., Rosenthal, E. A., Lingren, T., Feng, Q. P., Kullo, I. J., Narita, A., Takayama, J., Martin, H. C., Hunt, K. A., Trivedi, B., Haessler, J., Giulianini, F., Bradford, Y., Miller, J. E., Campbell, A., Lin, K., Millwood, I. Y., Rasheed, A., Hindy, G., Faul, J. D., Zhao, W., Weir, D. R., Turman, C., Huang, H., Graff, M., Choudhury, A., Sengupta, D., Mahajan, A., Brown, M. R., Zhang, W., Yu, K., Schmidt, E. M., Pandit, A., Gustafsson, S., Yin, X., Luan, J., Zhao, J. H., Matsuda, F., Jang, H. M., Yoon, K., Medina-Gomez, C., Pitsillides, A., Hottenga, J. J., Wood, A. R., Ji, Y., Gao, Z., Haworth, S., Yousri, N. A., Mitchell, R. E., Chai, J. F., Aadahl, Mette, Bjerregaard, A. A., Yao, J., Manichaikul, A., Hwu, C. M., Hung, Y. J., Warren, H. R., Ramirez, J., Bork-Jensen, J., Kårhus, L. L., Goel, A., Sabater-Lleal, M., Noordam, R., Mauro, P., Matteo, F., McDaid, A. F., Marques-Vidal, P., Wielscher, M., Trompet, S., Sattar, N., Møllehave, L. T., Munz, M., Zeng, L., Huang, J., Yang, B., Poveda, A., Kurbasic, A., Lamina, C., Forer, L., Scholz, M., Galesloot, T. E., Bradfield, J. P., Ruotsalainen, S. E., Daw, E., Zmuda, J. M., Mitchell, J. S., Fuchsberger, C., Christensen, H., Brody, J. A., Vazquez-Moreno, M., Feitosa, M. F., Wojczynski, M. K., Wang, Z., Preuss, M. H., Mangino, M., Christofidou, P., Verweij, N., Benjamins, J. W., Engmann, J., Tsao, N. L., Verma, A., Slieker, R. C., Lo, K. S., Zilhao, N. R., Le, P., Kleber, M. E., Delgado, G. E., Huo, S., Ikeda, D. D., Iha, H., Yang, J., Liu, J., Demirkan, A., Leonard, H. L., Marten, J., Frank, M., Schmidt, B., Smyth, L. J., Cañadas-Garre, M., Wang, C., Nakatochi, M., Wong, A., Hutri-Kähönen, N., Sim, X., Xia, R., Huerta-Chagoya, A., Fernandez-Lopez, J. C., Lyssenko, V., Nongmaithem, S. S., Bayyana, S., Stringham, H. M., Irvin, M. R., Oldmeadow, C., Kim, H. N., Ryu, S., Timmers, P. R. H. J., Arbeeva, L., Dorajoo, R., Lange, L. A., Prasad, G., Lorés-Motta, L., Pauper, M., Long, J., Li, X., Theusch, E., Takeuchi, F., Spracklen, C. N., Loukola, A., Bollepalli, S., Warner, S. C., Wang, Y. X., Wei, W. B., Nutile, T., Ruggiero, D., Sung, Y. J., Chen, S., Liu, F., Yang, J., Kentistou, K. A., Banas, B., Nardone, G. G., Meidtner, K., Bielak, L. F., Smith, J. A., Hebbar, P., Farmaki, A. E., Hofer, E., Lin, M., Concas, M. P., Vaccargiu, S., van der Most, P. J., Pitkänen, N., Cade, B. E., van der Laan, S. W., Chitrala, K. N., Weiss, S., Bentley, A. R., Doumatey, A. P., Adeyemo, A. A., Lee, J. Y., Petersen, E. R. B., Nielsen, A. A., Choi, H. S., Nethander, M., Freitag-Wolf, S., Southam, L., Rayner, N. W., Wang, C. A., Lin, S. Y., Wang, J. S., Couture, C., Lyytikäinen, L. P., Nikus, K., Cuellar-Partida, G., Vestergaard, H., Hidalgo, B., Giannakopoulou, O., Cai, Q., Obura, M. O., van Setten, J., Li, X., Liang, J., Tang, H., Terzikhan, N., Shin, J. H., Jackson, R. D., Reiner, A. P., Martin, L. W., Chen, Z., Li, L., Kawaguchi, T., Thiery, J., Bis, J. C., Launer, L. J., Li, H., Nalls, M. A., Raitakari, O. T., Ichihara, S., Wild, S. H., Nelson, C. P., Campbell, H., Jäger, S., Nabika, T., Al-Mulla, F., Niinikoski, H., Braund, P. S., Kolcic, I., Kovacs, P., Giardoglou, T., Katsuya, T., de Kleijn, D., de Borst, G. J., Kim, E. K., Adams, H. H. H., Ikram, M. A., Zhu, X., Asselbergs, F. W., Kraaijeveld, A. O., Beulens, J. W. J., Shu, X. O., Rallidis, L. S., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Mitchell, P., Hewitt, A. W., Kähönen, M., Pérusse, L., Bouchard, C., Tönjes, A., Chen, Y. D. I., Pennell, C. E., Mori, T. A., Lieb, W., Franke, A., Ohlsson, C., Mellström, D., Cho, Y. S., Lee, H., Yuan, J. M., Koh, W. P., Rhee, S. Y., Woo, J. T., Heid, I. M., Stark, K. J., Zimmermann, M. E., Völzke, H., Homuth, G., Evans, M. K., Zonderman, A. B., Polasek, O., Pasterkamp, G., Hoefer, I. E., Redline, S., Pahkala, K., Oldehinkel, A. J., Snieder, H., Biino, G., Schmidt, R., Schmidt, H., Bandinelli, S., Dedoussis, G., Thanaraj, T. A., Kardia, S. L. R., Peyser, P. A., Kato, N., Schulze, M. B., Girotto, G., Böger, C. A., Jung, B., Joshi, P. K., Bennett, D. A., De Jager, P. L., Lu, X., Mamakou, V., Brown, M., Caulfield, M. J., Munroe, P. B., Guo, X., Ciullo, M., Jonas, J. B., Samani, N. J., Kaprio, J., Pajukanta, P., Tusié-Luna, T., Aguilar-Salinas, C. A., Adair, L. S., Bechayda, S. A., de Silva, H. J., Wickremasinghe, A. R., Krauss, R. M., Wu, J. Y., Zheng, W., Hollander, A. I., Bharadwaj, D., Correa, A., Wilson, J. G., Lind, L., Heng, C. K., Nelson, A. E., Golightly, Y. M., Wilson, J. F., Penninx, B., Kim, H. L., Attia, J., Scott, R. J., Rao, D. C., Arnett, D. K., Hunt, S. C., Walker, M., Koistinen, H. A., Chandak, G. R., Mercader, J. M., Costanzo, M. C., Jang, D., Burtt, N. P., Villalpando, C. G., Orozco, L., Fornage, M., Tai, E., van Dam, R. M., Lehtimäki, T., Chaturvedi, N., Yokota, M., Liu, J., Reilly, D. F., McKnight, A. J., Kee, F., Jöckel, K. H., McCarthy, M. I., Palmer, C. N. A., Vitart, V., Hayward, C., Simonsick, E., van Duijn, C. M., Jin, Z. B., Qu, J., Hishigaki, H., Lin, X., März, W., Gudnason, V., Tardif, J. C., Lettre, G., Hart, L. M. T., Elders, P. J. M., Damrauer, S. M., Kumari, M., Kivimaki, M., van der Harst, P., Spector, T. D., Loos, Ruth, Province, M. A., Parra, E. J., Cruz, M., Psaty, B. M., Brandslund, I., Pramstaller, P. P., Rotimi, C. N., Christensen, K., Ripatti, S., Widén, E., Hakonarson, H., Grant, S. F. A., Kiemeney, L. A. L. M., de Graaf, J., Loeffler, M., Kronenberg, F., Gu, D., Erdmann, J., Schunkert, H., Franks, P. W., Linneberg, Allan René, Jukema, J. W., Khera, A. V., Männikkö, M., Jarvelin, M. R., Kutalik, Z., Francesco, C., Mook-Kanamori, D. O., van Dijk, K. W., Watkins, H., Strachan, D. P., Grarup, Niels, Sever, P., Poulter, N., Chuang, L. M., Rotter, J. I., Dantoft, T. M., Karpe, F., Neville, M. J., Timpson, N. J., Cheng, C. Y., Wong, T. Y., Khor, C. C., Li, H., Sabanayagam, C., Peters, A., Gieger, C., Hattersley, A. T., Pedersen, N. L., Magnusson, P. K. E., Boomsma, D. I., Willemsen, A. H. M., Cupples, L., van Meurs, J. B. J., Ghanbari, M., Gordon-Larsen, P., Huang, W., Kim, Y. J., Tabara, Y., Wareham, N. J., Langenberg, C., Zeggini, E., Kuusisto, J., Laakso, M., Ingelsson, E., Abecasis, G., Chambers, J. C., Kooner, J. S., de Vries, P. S., Morrison, A. C., Hazelhurst, S., Ramsay, M., North, K. E., Daviglus, M., Kraft, P., Martin, N. G., Whitfield, J. B., Abbas, S., Saleheen, D., Walters, R. G., Holmes, M. V., Black, C., Smith, B. H., Baras, A., Justice, A. E., Buring, J. E., Ridker, P. M., Chasman, D. I., Kooperberg, C., Tamiya, G., Yamamoto, M., van Heel, D. A., Trembath, R. C., Wei, W. Q., Jarvik, G. P., Namjou, B., Hayes, M. G., Ritchie, M. D., Jousilahti, P., Salomaa, V., Hveem, K., Åsvold, B. O., Kubo, M., Kamatani, Y., Okada, Y., Murakami, Y., Kim, B. J., Thorsteinsdottir, U., Stefansson, K., Zhang, J., Chen, Y., Ho, Y. L., Lynch, J. A., Rader, D. J., Tsao, P. S., Chang, K. M., Cho, K., O'Donnell, C. J., Gaziano, J. M., Wilson, P. W. F., Frayling, T. M., Hirschhorn, J. N., Kathiresan, S., Mohlke, K. L., Sun, Y. V., Morris, A. P., Boehnke, M., Brown, C. D., Natarajan, P., Deloukas, P., Willer, C. J., Assimes, T. L. & Peloso, G. M., 2022, In: Genome Biology. 23, 1, 42 p., 268.

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Multi-ancestry genetic study of type 2 diabetes highlights the power of diverse populations for discovery and translation

Mahajan, A., Spracklen, C. N., Zhang, W., Ng, M. C. Y., Petty, L. E., Kitajima, H., Yu, G. Z., Rüeger, S., Speidel, L., Kim, Y. J., Horikoshi, M., Mercader, J. M., Taliun, D., Moon, S., Kwak, S-H., Robertson, N. R., Rayner, N. W., Loh, M., Kim, B-J., Chiou, J. & 31 others, Miguel-Escalada, I., Della Briotta Parolo, P., Lin, K., Bragg, F., Preuss, M. H., Takeuchi, F., Nano, J., Guo, X., Lamri, A., Nakatochi, M., Scott, R. A., Lee, J., Huerta-Chagoya, A., Graff, M., Chai, J., Parra, E. J., Yao, J., Bielak, L. F., Grarup, Niels, Chen, W., Bork-Jensen, J., Islam, M. T., Jørgensen, M. E., Jørgensen, T., Linneberg, Allan René, Witte, D. R., Lind, L., Loos, Ruth, Hansen, Torben, Pedersen, Oluf Borbye & FinnGen, F., 2022, In: Nature Genetics. 54, 5, p. 560-572 13 p.

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Mendelian randomization supports bidirectional causality between telomere length and clonal hematopoiesis of indeterminate potential

Nakao, T., Bick, A. G., Taub, M. A., Zekavat, S. M., Uddin, M. M., Niroula, A., Carty, C. L., Lane, J., Honigberg, M. C., Weinstock, J. S., Pampana, A., Gibson, C. J., Griffin, G. K., Clarke, S. L., Bhattacharya, R., Assimes, T. L., Emery, L. S., Stilp, A. M., Wong, Q., Broome, J. & 32 others, Laurie, C. A., Khan, A. T., Smith, A. V., Blackwell, T. W., Codd, V., Nelson, C. P., Yoneda, Z. T., Peralta, J. M., Bowden, D. W., Irvin, M. R., Boorgula, M., Zhao, W., Yanek, L. R., Wiggins, K. L., Hixson, J. E., Charles Gu, C., Peloso, G. M., Roden, D. M., Reupena, M. S., Hwu, C. M., DeMeo, D. L., North, K. E., Kelly, S., Musani, S. K., Bis, J. C., Lloyd-Jones, D. M., Johnsen, J. M., Preuss, M., Tracy, R. P., Loos, Ruth, The Samoan Obesity, Lifestyle and Genetic Adaptations Study (OLaGA) Group, T. S. O. L. A. G. A. S. (. G. & NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) Consortium, N. T. F. P. M. (. C., 2022, In: Science Advances. 8, 14, eabl6579.

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Dysregulation of macrophage PEPD in obesity determines adipose tissue fibro-inflammation and insulin resistance

Pellegrinelli, V., Rodriguez-Cuenca, S., Rouault, C., Figueroa-Juarez, E., Schilbert, H., Virtue, S., Moreno-Navarrete, J. M., Bidault, G., Vázquez-Borrego, M. C., Dias, A. R., Pucker, B., Dale, M., Campbell, M., Carobbio, S., Lin, Y. H., Vacca, M., Aron-Wisnewsky, J., Mora, S., Masiero, M. M., Emmanouilidou, A. & 8 others, Mukhopadhyay, S., Dougan, G., den Hoed, M., Loos, Ruth, Fernández-Real, J. M., Chiarugi, D., Clément, K. & Vidal-Puig, A., 2022, In: Nature Metabolism. 4, 4, p. 476-494 19 p.

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A multi-layer functional genomic analysis to understand noncoding genetic variation in lipids

Ramdas, S., Judd, J., Graham, S. E., Kanoni, S., Wang, Y., Surakka, I., Wenz, B., Clarke, S. L., Chesi, A., Wells, A., Bhatti, K. F., Vedantam, S., Winkler, T. W., Locke, A. E., Marouli, E., Zajac, G. J. M., Wu, K. H. H., Ntalla, I., Hui, Q., Klarin, D. & 32 others, Hilliard, A. T., Wang, Z., Xue, C., Thorleifsson, G., Helgadottir, A., Gudbjartsson, D. F., Holm, H., Olafsson, I., Hwang, M. Y., Han, S., Zhao, J. H., Aadahl, Mette, Bork-Jensen, J., Møllehave, L. T., Liu, J., Wang, J., drb459, drb459, Jackson, R. D., Kovacs, P., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Lind, L., Loos, Ruth, Christensen, K., Linneberg, Allan René, Grarup, Niels, Dantoft, T. M., Karpe, F., Wei, W. Q., Sun, Y. V., Million Veterans Program, M. V. P. & Global Lipids Genetics Consortium, G. L. G. C., 2022, In: American Journal of Human Genetics. 109, 8, p. 1366-1387 22 p.

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